Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DSPP15924 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DSPP15924 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSPP15924 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSPP15924 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSPP15924 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSPP15924 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms