Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IGKV3-15P01624 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms