Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms