Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms