Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NAGK-214ENST00000478659 677 ntTSL 311.83□□□□□ -0.511e-21■■■■■ 38.4
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PRPF8Q6P2Q9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 38.2
PRPF8Q6P2Q9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 38.2
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PRPF8Q6P2Q9 FBXL6-208ENST00000530142 3108 ntTSL 1 (best)12.92□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 38.2
PRPF8Q6P2Q9 TOMM40-206ENST00000592041 707 ntTSL 213.7□□□□□ -0.225e-9■■■■■ 38.2
PRPF8Q6P2Q9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 38.2
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PRPF8Q6P2Q9 NCAPD3-208ENST00000530396 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.92□□□□□ -1.142e-13■■■■■ 38.2
PRPF8Q6P2Q9 ALB-207ENST00000486939 345 ntTSL 21.22□□□□□ -2.218e-27■■■■■ 38.2
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