Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HADHQ16836 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HADHQ16836 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HADHQ16836 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HADHQ16836 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HADHQ16836 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms