Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL4A6Q14031 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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