Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NHLH2Q02577 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms