Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCCQ00597 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCCQ00597 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms