Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX6P78412 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX6P78412 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX6P78412 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX6P78412 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX6P78412 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX6P78412 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX6P78412 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX6P78412 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms