Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms