Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGHV1-8P0DP01 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms