Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTA1P02549 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTA1P02549 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms