Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP1O00294 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP1O00294 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP1O00294 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms