Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NOTOA8MTQ0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms