Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A4D1N5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A4D1N5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
A4D1N5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
A4D1N5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
A4D1N5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
A4D1N5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
A4D1N5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
A4D1N5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A4D1N5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms