Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HPSEQ9Y251 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPSEQ9Y251 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms