Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW11Q9UKB1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW11Q9UKB1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms