Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRP68Q9UHB9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms