Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA3Q9BTC8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA3Q9BTC8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms