Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC22CQ9BRL7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC22CQ9BRL7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms