Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms