Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEIS3Q99687 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEIS3Q99687 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms