Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG1Q96Q15 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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