Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C17orf53Q8N3J3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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