Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM47EQ6ZV65 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms