Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIVEP3Q5T1R4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIVEP3Q5T1R4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms