Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKIDA1Q1XH10 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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