Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.765e-7■■■□□ 19.1
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PCBP1Q15365 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-8■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-8■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 TPI1-209ENST00000535434 1587 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.484e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 MAPK12-204ENST00000467891 2019 ntTSL 530.28■■■□□ 2.446e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.216e-6■■■□□ 19.1
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PCBP1Q15365 MAPK12-206ENST00000488504 1785 ntTSL 524.57■■□□□ 1.526e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 RHOF-207ENST00000546227 1219 ntTSL 524.03■■□□□ 1.446e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.356e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 PKD1P6-203ENST00000538100 705 ntTSL 323.31■■□□□ 1.326e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.266e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 EHBP1L1-205ENST00000529099 490 ntTSL 522.66■■□□□ 1.225e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.016e-6■■■□□ 19.1
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PCBP1Q15365 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 218.49■□□□□ 0.556e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 518.43■□□□□ 0.546e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 518.26■□□□□ 0.516e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 MAPK12-208ENST00000496942 2763 ntTSL 217.75■□□□□ 0.436e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.336e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 LINC01089-208ENST00000541694 875 ntTSL 216.48■□□□□ 0.236e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.056e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 ESYT1-206ENST00000550515 716 ntTSL 214.17□□□□□ -0.149e-8■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.285e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 FAXDC2-215ENST00000524250 3105 ntTSL 210.95□□□□□ -0.665e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.724e-6■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 FAXDC2-202ENST00000423554 3817 ntTSL 29.27□□□□□ -0.935e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -15e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 FAXDC2-210ENST00000520581 868 ntTSL 48.21□□□□□ -1.15e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-8■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 27.32□□□□□ -1.243e-8■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 KLK1-203ENST00000593859 992 ntTSL 219.14■□□□□ 0.654e-15■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.244e-15■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 KLK1-202ENST00000593325 1854 ntTSL 214.55□□□□□ -0.084e-15■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 BAG6-256ENST00000462682 349 ntTSL 212.72□□□□□ -0.372e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.324e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.654e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.214e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.334e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 SLC26A6-216ENST00000469693 574 ntTSL 310.42□□□□□ -0.744e-11■■■□□ 19.1
PCBP1Q15365 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.074e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.784e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.142e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.784e-7■■■□□ 19
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PCBP1Q15365 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.014e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.014e-9■■■□□ 19
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PCBP1Q15365 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.024e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.034e-9■■■□□ 19
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PCBP1Q15365 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.174e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.174e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.234e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.234e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.274e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.274e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.274e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.414e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.414e-9■■■□□ 19
PCBP1Q15365 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.897e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.637e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.357e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)23.47■■□□□ 1.351e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 521.81■■□□□ 1.081e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.931e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 520.65■□□□□ 0.91e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)20.14■□□□□ 0.811e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.791e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.641e-7■■■□□ 19
PCBP1Q15365 SREBF2-206ENST00000464119 432 ntTSL 212.95□□□□□ -0.348e-12■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 SREBF2-204ENST00000462539 796 ntTSL 27.51□□□□□ -1.218e-12■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 SSBP3-201ENST00000326956 2913 ntTSL 214.61□□□□□ -0.076e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 TMC6-214ENST00000590162 517 ntTSL 216.72■□□□□ 0.279e-10■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-210ENST00000440825 855 ntTSL 330.72■■■□□ 2.512e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.462e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-207ENST00000420515 1544 ntTSL 1 (best)29.81■■■□□ 2.362e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.122e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-201ENST00000378543 569 ntTSL 226.09■■□□□ 1.772e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-206ENST00000414253 2216 ntTSL 225.26■■□□□ 1.632e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-203ENST00000400918 811 ntTSL 224.88■■□□□ 1.572e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-209ENST00000428120 2313 ntTSL 1 (best)24.53■■□□□ 1.522e-7■■■□□ 18.9
PCBP1Q15365 FAAP20-205ENST00000401813 2543 ntTSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.632e-7■■■□□ 18.9
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