Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIXQ14938 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIXQ14938 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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