Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TMEM135-206ENST00000529023 1095 ntTSL 26.14□□□□□ -1.437e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 USP7-207ENST00000563085 3194 ntTSL 26.1□□□□□ -1.437e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 USP7-209ENST00000564117 479 ntTSL 45.63□□□□□ -1.517e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 KIAA1551-204ENST00000535596 965 ntTSL 25.56□□□□□ -1.527e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 RSPRY1-209ENST00000564530 3361 ntTSL 25.21□□□□□ -1.577e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.627e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PIP5K1A-214ENST00000481713 474 ntTSL 24.88□□□□□ -1.637e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.377e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.387e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 NECAP2-206ENST00000492095 1787 ntTSL 212.51□□□□□ -0.417e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 AC005381.1-201ENST00000593065 769 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 NECAP2-207ENST00000496239 4619 ntTSL 211.07□□□□□ -0.647e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.757e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.047e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 33.28□□□□□ -1.887e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 19.8
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ILF3Q12906 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-7■■■■□ 19.8
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ILF3Q12906 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 57.31□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.334e-7■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.434e-7■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.854e-10■■■■□ 19.8
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