Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNB3Q05901 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms