Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPC5P78333 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPC5P78333 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPC5P78333 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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GPC5P78333 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GPC5P78333 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GPC5P78333 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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