Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHOBP62745 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOBP62745 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOBP62745 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOBP62745 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOBP62745 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOBP62745 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms