Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPTEP56180 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPTEP56180 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPTEP56180 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms