Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL23P55773 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL23P55773 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCL23P55773 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCL23P55773 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCL23P55773 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCL23P55773 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL23P55773 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL23P55773 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms