Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPT1P50897 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPT1P50897 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PPT1P50897 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPT1P50897 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPT1P50897 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPT1P50897 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPT1P50897 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PPT1P50897 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms