Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2IP36954 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms