Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB2A8KAH6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB2A8KAH6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB2A8KAH6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms