Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX12Q9UMY4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms