Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms