Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R5

GBP3, Guanylate-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP3Q9H0R5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GBP3Q9H0R5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms