Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CNBD2Q96M20 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms