Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APH1BQ8WW43 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APH1BQ8WW43 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms