Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00518Q8N0U6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms