Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00299Q6ZSB3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms