Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC70Q6NSX1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms