Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q5VSD8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q5VSD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q5VSD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q5VSD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q5VSD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q5VSD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q5VSD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q5VSD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q5VSD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q5VSD8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q5VSD8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms