Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C4orf46Q504U0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms