Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC6LQ2NKX8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC6LQ2NKX8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms